home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00150 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.9 KB  |  63 lines

  1. *******************************************
  2. * Enoyl-CoA hydratase/isomerase signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Enoyl-CoA hydratase (EC 4.2.1.17)  (ECH) [1]  and 3-2trans-enoyl-CoA isomerase
  6. (EC 5.3.3.8) (ECI) [2] are two enzymes involved in fatty acid metabolism.  ECH
  7. catalyzes the hydratation of 2-trans-enoyl-CoA into 3-hydroxyacyl-CoA  and ECI
  8. shifts the 3- double  bond  of  the  intermediates  of  unsaturated fatty acid
  9. oxidation to the 2-trans position.
  10.  
  11. Most eukaryotic cells have two fatty-acid  beta-oxidation systems, one located
  12. in mitochondria and the other in peroxisomes. In mitochondria, ECH and ECI are
  13. separate yet structurally related monofunctional enzymes.  Peroxisomes contain
  14. a trifunctional  enzyme [3] consisting of an N-terminal domain that bears both
  15. ECH and  ECI  activity, and a C-terminal domain responsible for 3-hydroxyacyl-
  16. CoA dehydrogenase (HCDH) activity.
  17.  
  18. In Escherichia coli (gene fadB) and Pseudomonas fragi (gene faoA), ECH and ECI
  19. are also  part  of  a multifunctional  enzyme which contains both a HCDH and a
  20. 3-hydroxybutyryl-CoA epimerase domain [4].
  21.  
  22. A number  of other proteins  have been found to be evolutionary related to the
  23. ECH/ECI enzymes or domains:
  24.  
  25.  - Naphthoate  synthase  (EC 4.1.3.36)  (DHNA synthetase)  (gene menB) [5],  a
  26.    bacterial enzyme involved in the biosynthesis  of menaquinone (vitamin K2).
  27.    DHNA synthetase converts O-succinyl-benzoyl-CoA (OSB-CoA) to 1,4-dihydroxy-
  28.    2-naphthoic acid (DHNA).
  29.  - 4-chlorobenzoate dehalogenase (EC 3.8.1.6) [6], a  Pseudomonas enzyme which
  30.    catalyzes the conversion of 4-chlorobenzoate-CoA to 4-hydroxybenzoate-CoA.
  31.  - A Rhodobacter capsulatus protein of unknown function (ORF257) [7].
  32.  - Escherichia coli hypothetical protein yaaL.
  33.  - A hypothetical yeast protein encoded in the 5'region of gene KRS1.
  34.  
  35. As a signature pattern for these enzymes, we selected  a conserved region rich
  36. in glycine and hydrophobic residues.
  37.  
  38. -Consensus pattern: [LIVM]-[STA]-x-[LIVM]-[DNQSTA]-G-x(3)-[AG](3)-x(4)-[LIVM]-
  39.                     x-[CSTA]-[DHP]-[LIVMFY]
  40. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  41. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Pasteurella haemolytica leukotoxin.
  42.  
  43. -Expert(s) to contact by email: Hofmann K.O.
  44.                                 khofmann@isrec-sun1.unil.ch
  45.  
  46. -Last update: June 1994 / Text revised.
  47.  
  48. [ 1] Minami-Ishii N., Taketani S., Osumi T., Hashimoto T.
  49.      Eur. J. Biochem. 185:73-78(1989).
  50. [ 2] Mueller-Newen G., Stoffel W.
  51.      Biol. Chem. Hoppe-Seyler 372:613-624(1991).
  52. [ 3] Palosaari P.M., Hiltunen J.K.
  53.      J. Biol. Chem. 265:2446-2449(1990).
  54. [ 4] Nakahigashi K., Inokuchi H.
  55.      Nucleic Acids Res. 18:4937-4937(1990).
  56. [ 5] Driscoll J.R., Taber H.W.
  57.      J. Bacteriol. 174:5063-5071(1992).
  58. [ 6] Babbitt P.C., Kenyon G.L., Matin B.M., Charest H., Sylvestre M.,
  59.      Scholten J.D., Chang K.-H., Liang P.-H., Dunaway-Mariano D.
  60.      Biochemistry 31:5594-5604(1992).
  61. [ 7] Beckman D.L., Kranz R.G.
  62.      Gene 107:171-172(1991).
  63.